馬鞍山市人民醫院分為本部和東院兩個院區。

馬鞍山市人民醫院東院位于風景秀麗的秀山湖畔，總建設面積17.39萬㎡（含加速器醫療用房2690㎡），床位數為1490張，估算總投資10.4億元，分兩期建設完成。其中一期已于2020年10月18日正式投入運行，二期工程現已基本完成，即將投入使用。

東院一期項目占地113畝，建筑面積9.72萬㎡，開放床位590張，實際可開放最大床位777張?，F開設的臨床科室有呼吸與危重癥學科、風濕免疫科、中醫科、腫瘤化療科、腫瘤放療科、腫瘤介入科、心血管內科、內分泌科、老年醫學科、康復醫學科、消化內科、普外綜合科、兒科及新生兒科，設有6個專病門診。手術室18間，DSA室2間，ICU床位40張。醫技科室齊全，配置西門子3.0T核磁共振、GE1.5T核磁共振、飛利浦128排1024高清CT、西門子64排CT、直線加速器Elekta Infinity、銳科雙板DR、GE乳腺鉬靶等先進設備，PET/CT已裝機正在調試中。

東院二期占地78.5畝，總建筑面積7.4萬㎡，設計床位數865張，實際可開放最大床位數為1083張。東院二期病區、急診科及兒科門診待時機成熟，分步開放。